Yan St-Pierre travaille sur la question du terrorisme depuis 1995. Il fournit des analyses et collabore sur des projets de recherches sur l’extrême-droite, l’extrême-gauche et le terrorisme religieux à travers le monde, notamment en Afrique, en Amérique du nord, en Europe et en Asie. Il a une abondante expérience de terrain en matière de contre-terrorisme et de sécurité, notamment dans les Balkans, en Afrique de l’est et de l’ouest, en Asie centrale, et dans de nombreuses autres régions. Il croit que la polyvalence est un atout essentiel, et cela se reflète dans son travail par son aisance tant dans un environnement académique qu’en zone de conflit.
À titre de PDG et consultant de contre-terrorisme du Groupe de consultation de sécurité moderne MOSECON GmbH, il conseille des chefs d’état et de gouvernement, des gouvernements, des ONG et des société privées sur le développement et l’application de stratégies de contre-terrorisme et de sécurité qui reflètent la réalité du terrain. Ses conseils tiennent compte de tous les aspects du contre-terrorisme incluant des mesures sociales telles que les programmes de désengagement (déradicalisation) ou des initiatives d’après-conflit. Il croit que les stratégies de contre-terrorisme doivent être entièrement utilisables, adaptables, flexibles, simultanées et pluridimensionnelles, le tout devant égaler la vitesse d’exécution et la flexibilité des terroristes, tout en tenant compte des réalités politiques.
Ses analyses et conseils sont aussi prisés des médias, et il est un contributeur régulier sur les questions de terrorisme et de sécurité entre autres pour France 24, Radio-Canada, Le Devoir, Le Monde, RFI, ARD, le Wall Street Journal et la BBC.